Shadow Empires introduce un nou concept în joc – facțiunile. La start, jucătorii își aleg tribul și facțiunea. Există 5 facțiuni și fiecare va începe jocul într-un loc diferit pe hartă:

Imperiul – în centru	Dinastia – în sud-est
Rebelii – in nord-vest	Hoarda – în est
Jefuitorii – în nord

La început, jucătorii noi care aparțin de aceeași facțiune vor începe jocul în aceeași regiune. Odată ce regiunea s-a umplut, noii jucători vor fi plasați într-o regiune din apropiere, și așa mai departe. Nu se ține cont de cadran sau de distanța de la centru.

Regiuni

Facțiunile nu determină doar poziția de start a jucătorilor, ci introduce un nou nivel de cooperare în rândul jucătorilor.

Regiunile sunt acum cucerite de facțiuni, nu de către alianțe individuale. Atât facțiunile, cât și alianțele care au ajutat la cucerirea regiunilor vor câștiga puncte de victorie. Cu toate acestea, doar o singură alianță poate accesa puterea antică a acelei regiuni. Pentru mai multe detalii, verifică articolul despre regiuni și puteri antice.

Jucători și alianțe în facțiuni

Jucătorii își selectează facțiunea la înregistrarea contului și aceasta nu mai poate fi modificată.

O alianță aparține facțiunii jucătorului care a fondat alianța. Nici aceasta nu mai poate fi modificată ulterior.

Însă jucătorii au posibilitatea să se alăture unei alte alianțe oricând doresc.Așadar, chiar dacă ai început jocul jucând pentru Rebeli, te poți alătura unei alianțe care aparține Hoardei, sau oricărei alte facțiuni.